CRISPR擴(kuò)增子測序
CRISPR基因編輯技術(shù)不僅引起了基因編輯領(lǐng)域的一場革命,也為基因治療開辟了廣泛的應(yīng)用前景。基因編輯的結(jié)果可以采用DNA測序方法進(jìn)行確認(rèn)。當(dāng)樣本或靶位點(diǎn)較多時,傳統(tǒng)的Sanger測序無法快速有效地鑒定基因編輯效率,適合采用高通量測序,即通過對靶基因區(qū)域附近設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后對擴(kuò)增子(amplicon)測序,可以快速高效地獲得目標(biāo)區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于一代測序。
泓迅生物根據(jù)不同的高通量測序平臺,可提供不同讀長的擴(kuò)增測序服務(wù),用于CRISPR篩選文庫驗(yàn)證、CRISPR編輯效率檢測等,幫助研究人員快速定位基因突變位點(diǎn)和研究基因功能。
服務(wù)優(yōu)勢
-
- 一次上機(jī)可以進(jìn)行數(shù)百到數(shù)千個擴(kuò)增子的多重分析
-
- 可用于各種突變驗(yàn)證和篩選遺傳變異
-
- 提供個性化的生物信息分析服務(wù)
-
- 與全基因組測序相比,成本低周期短
服務(wù)詳情
擴(kuò)增長度
|
樣本要求
|
測序平臺
|
價格
|
周期
|
交付內(nèi)容
|
70-280bp
|
? 需要PCR 產(chǎn)物或者提取好的基因組
? 客戶富集好的靶向區(qū)域PCR產(chǎn)物,建議濃度大于10 ng/μL,總量1-5 μg,以Qubit 2.0檢測結(jié)果為準(zhǔn)
? 客戶需要提供擴(kuò)增引物以及參考序列
|
Illumina 2×150 bp
|
1500元起/5G
|
3周
|
? FASTQ格式的原始數(shù)據(jù)
? 數(shù)據(jù)分析報告
|
280-480bp
|
Illumina 2×250 bp
|
咨詢
|
服務(wù)流程
常見問題
1. 特異性問題:
gRNA(或crRNA)的設(shè)計(jì)至關(guān)重要,其準(zhǔn)確性直接影響到CRISPR系統(tǒng)的特異性。設(shè)計(jì)不當(dāng)可能導(dǎo)致非特異性切割,進(jìn)而影響到非目標(biāo)基因。因此,在選擇目標(biāo)序列時,應(yīng)確保其特異性,并避免與非目標(biāo)基因發(fā)生錯配。
2. Off-target效應(yīng):
CRISPR技術(shù)中的Cas9蛋白可能在目標(biāo)位點(diǎn)以外的地方發(fā)生切割,即產(chǎn)生Off-target效應(yīng)。為減少這種效應(yīng),研究人員需要采用合適的技術(shù)來評估和減輕這些非特異性切割,例如通過全基因組測序來檢測潛在的Off-target位點(diǎn)。
訂購 | 咨詢
相關(guān)服務(wù)